Z-ARG-LEU-ARG-GLY-GLY{-AMC CAS 167698-69-3

Li souvan itilize kòm yon substrate peptide pou SARS-CoV PLpro (Sendwòm Respiratwa Aigu Grav Coronavirus Papay tankou Proteaz). SARS-CoV se yon coronavirus, ak PLpro li se yon anzim kle nan pwosesis replikasyon viris la, k ap patisipe nan pwosesis pwoteyin polimerik viral yo. Se poutèt sa, li gen yon valè aplikasyon enpòtan nan etidye mekanis replikasyon SARS-CoV, tès depistaj dwòg antiviral, ak devlopman vaksen.

Li kapab tou sèvi kòm yon sond fliyoresan pou D 'byolojik ak rechèch lokalizasyon selil. Akòz prezans gwoup AMC (amino methyl coumarin), peptide sa a montre pwopriyete fliyoresan epi li ka emèt fliyoresans anba eksitasyon. Sa a pèmèt etikèt molekil espesifik oswa estrikti nan selil ak tisi, kidonk revele chanjman dinamik pwosesis byolojik yo.

Li kapab tou itilize pou tès depistaj inhibitor gwo-debi ak analiz kontinyèl. Nan pwosesis devlopman dwòg, li enpòtan pou jwenn konpoze ki ka efektivman anpeche aktivite anzim espesifik oswa pwoteyin. Kòm yon substra peptide pou PLpro, li ka itilize ansanm ak potansyèl inhibiteurs pou evalye aktivite yo lè yo mezire chanjman nan pousantaj idroliz substra. Metòd sa a gen avantaj ki genyen nan debi segondè, sansiblite segondè, ak espesifik segondè, ki ka anpil akselere pwosesis la nan tès depistaj dwòg.

Anplis de sa, li kapab tou aplike nan rechèch iminolojik. Sibstans peptides jwe yon wòl enpòtan nan sistèm iminitè a epi yo ka patisipe nan repons iminitè a kòm antijèn oswa antikò. Sekans espesifik ak estrikti Z-ARG-LEU-ARG{-GLY-AMC ka bay li iminojenisite oswa iminoreaktivite, ki fè li apwopriye pou preparasyon antikò, vaksen, oswa reyaktif imunodyagnostik.

PLpro responsab pou pwosesis poliprotein viris ak chape iminitè lame, epi li se yon sib kle pou dwòg antiviral. Z-LRGG-AMC, kòm yon substra espesifik PLpro, gen yon efikasite klivaj plis pase twa fwa pi wo pase substrats tradisyonèl tankou Z-Gly-Gly Arg AMC. Nan tès depistaj dwòg, potansyèl dwòg antiviral yo ka byen vit idantifye lè yo detekte pousantaj anpèchman nan konpoze sou PLpro klivaj Z-LRGG-AMC.

For example, a study used this substrate to screen candidate molecules with inhibition rate>90% nan yon bibliyotèk 100000 konpoze, bay sipò kle pou devlopman nan dwòg antiviral tankou remdesivir. Lè w konpare efikasite koupe diferan souch viris PLpro sou Z-LRGG-AMC, efè varyasyon viris la sou aktivite proteaz yo ka revele. Pa egzanp, pousantaj rediksyon SARS-CoV-2 PLpro sou Z-LRGG{-AMC se 1.5 fwa pi rapid pase SARS-CoV PLpro, sa ki sijere ke li ka gen pi fò kapasite regilasyon iminitè lame.

IPaseT ak lòt DUB kontwole degradasyon pwoteyin lè yo koupe sekans C-tèminal ubiquitin la. Z-LRGG-AMC simule estrikti C-tèminal ubiquitin, ak yon valè kcat/Km 18 M ⁻¹ s ⁻¹, sa ki fè li yon substrate ideyal pou etidye sinetik DUB. Pou egzanp, nan rechèch kansè, yo ka evalye relasyon ki genyen ant dezekilib omeyostaz pwoteyin ak pwogresyon timè pa detekte aktivite klivaj DUB sou Z-LRGG-AMC nan selil timè yo.

Konbine avèk teknoloji transfè enèji resonans fluoresans (FRET), Z-LRGG-AMC ka itilize pou swiv tan reyèl-nan pwosesis modifikasyon ubiquitination intraselilè. Pou egzanp, nan yon modèl maladi neurodegenerative, detekte nivo ubiquitination alfa sinuklein revele asosyasyon ki genyen ant agrégation li yo ak malfonksyònman proteasome.

Nan yon plak 384 pi, Z-LRGG-AMC te melanje ak konpoze tès la ak inhibiteurs anzim yo te rapidman tès depistaj pa chanjman siyal fluoresans. Metòd sa a gen gwo debi (ka ekran dè milye de konpoze chak jou) ak pri ki ba (pri sèl pò<0.1 USD), and has become a standard process for drug development. By changing the substrate concentration, the Km (Michaelis constant) and Vmax (maximum reaction rate) of the enzyme on Z-LRGG-AMC were determined, providing a theoretical basis for inhibitor design. For example, a study used this substrate to determine a Km value of 12 μ M for PLpro, providing key data for optimizing inhibitor affinity.